公共場所的坐式普通馬桶，由於使用人數眾多，導致馬桶座墊充滿著細菌，也導致馬桶座墊的髒亂，令女性上公司廁所，就望之卻步。有些女性如廁前，會用衛生紙擦拭馬桶座墊，但這樣馬桶座墊會沒有細菌嗎?或將衛生紙舖滿馬桶座墊，也有人甚至直接踩在馬桶上，除了危險外，也造成馬桶座墊損壞，而必須常常更換新的馬桶座墊，讓廁所維護成本增加。現代的廁所，除了乾淨以外，最講求貼心。
傳統坐式馬桶使用時、人體肌膚與馬桶座墊的 衛浴設備 直接接觸，肌膚沾滿殘留在馬桶座墊上的尿液，汗液與及各種細菌，極為容易導致皮膚病、性病等各種疾病的交叉感染。且最近國內外權威機構及專家也證實了，SARS除通過呼吸道飛沫傳播以外，也可通過尿液、汗液傳播，而在公共場所使用傳統坐式馬桶時，「馬桶座墊」----是通過尿液、汗液傳染疾病的最佳途徑。所以，傳統坐式馬桶存在的衛生弊端，致使我們對坐式馬桶的衛生問題存在著憂慮與畏懼。而最近的H1N1流感病毒，更容易透過接觸而感染。
馬桶墊上若是沒有安裝「馬桶自動保潔墊」或是坐墊紙，則公廁就容易髒亂。而馬桶墊上則容易被破壞，甚至會沾尿留鞋印，讓上公廁成為髒亂源。如果馬桶墊上又濕又髒，不但會影響環境美觀，也會影響國際形象。因為報導指出，公廁的清潔度，是文明國家的指標之一。
